ATOKではユーザ辞書が複数作れますので新しいユーザ辞書を作って そこにインポートします。 それから作った辞書を辞書セットに追加すると利用可能になります。
辞書ユーティリティを選択

辞書作成をクリック

適当な辞書の名前を入力します。ここでは「植物学名」としました。

ファイルから登録・削除を選ぶ

ダウンロードしたファイルを指定して登録をクリック

次に環境設定を選ぶ

辞書・学習のタブで、追加をクリック

さっき作った「植物学名」を選んで追加

これで使えるようになります。
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